Estagiando seus dados de EEG pra fazer polissonografia
Recentemente me deparei com a necessidade de estagiar os dados que coletei com EEG. Fiz todo o Processamento com o software BrainVision Analyzer, mas infelizmente o software não foi desenvolvido para realizarmos o estagiamento do sono.
Realizei 20 coletas de dados com 32 eletrodos utilizando um actiCHamp e o Recorder, para cada sujeitos coletamos a noite inteira de sono, pelo menos 10 horas por sujeito, Salvos no formato .edf e com tamanho médio de 2 GB cada.
Também realizei o pré-processamento desses dados utilizando o software BrainVision Analyzer. Apliquei filtro, Análise de componentes independentes (ICA), Inspeção de dados crús, segmentação, transformei alguns eletrodos e ajustei a referência.
Eu poderia ter utilizado os dados crús indo direto na pasta. Para utilizar os dados processados precisei exportar esses dados através de Export> EDF Export. Após isso o arquivo foi salvo na pasta em que defini como ”export” quando criei o Workspace no Analyzer.
Porém quando fui buscar por uma forma de estagiar esses dados pelo Analyzer, não encontrei. Então tive que buscar formas alternativas:
Uma delas foi usar a Toolbox “Hume”, do Matlab. Essa toolbox utiliza funções da toolbox EEGLAB e da toolbox Biosig. Essa toolbox foi desenvolvido por Jared M. Saletin PhD da Brown University em parceria com Stephanie Greer PhD.
Abaixo a descrição do site do hume:
“Hume is an open-source MATLAB program for scoring and analyzing sleep polysomnography and EEG building on the EEGLAB toolbox. Hume allows researchers to unify their sleep EEG workflow across different acquisition systems. If it can be loaded into EEGLAB, Hume can work with it. Hume supports event-marking, artifact-rejection, the generation of sleep statistic reports, inter-scorer reliability comparisons, and storing output in off- and on-line databases (work in progress).”
Neste site a toolbox pode ser baixada gratuitamente:
https://www.jaredsaletin.org/hume
Outro programa de estagiamento gratuito que encontrei foi o Neuron Spectrum. Este é o que decidi utilizar pois também é gratuito e não precisa de ter o Matlab instalado.
Este software é muito fácil de utilizar. Após a instalação Eu conseguir abrir o arquivo de EEG .edf facilmente. Pelo caminho Exame>Importar.
Similar ao Hume, o botões aparecem no local superior, mas no lado esquerdo. Os dados aparecem na região inferior e a visualização pode ter a sensibilidade e período de tempo alterados. Porém ele apresenta várias funções extras que eu ainda não explorei.
Ele apresenta a janela “Análise dos estágios do sono”, nela podemos ver as informações e porcentagens referentes ao estagiamento, bem como exportá-las pro Excel. E não é necessário ter finalizado o estagiamento para isso.
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